saludos en el launcher de EA tienes una opción para desactivar la descarga de actualizaciones de forma automática, además te sugiero que un día antes de actualizar muevas al escritorio las carpetas de mods, saves, y tray si tienes archivos en la misma, la forma mas rápida es un cortar y pegar, luego desactivas el reconocimiento de mods, descargas la actualización, y una vez instalada cierra el launcher y coloca de nuevo las carpetas en su lugar. luego entra en el juego y reactiva el reconocimiento de mods.
Otras sugerencias es que tengas una partida creada para testear los mods después de actualizar y revises si hay nuevas actualizaciones de los mods que tengas