No se activa mod script

Hola, hoy hice la actulizacion del juego. Volvi a meter el contenido personalizado , inicie, lo active y funciona perfectamente. 
El problema esta que cuando en opciones pongo activar "mods de script" y alguna opcion mas como "pantalla completa" y seguidamente "aplicar canvios" y cierro el juego y despues lo vuelvo iniciar, estos vuelven a estar sin modificar, es de decir no se me aplicacan los canvios de "mods de script" y "pantalla completa. No se que hacer nunca me habia pasado, nunca. Los archivos estan correctamente porque uso una app para detectar mods erroneos. 

Alguna solucion?

Gracias